Optimizing CRISPR-Cas9 Guide RNA Design via Multi-objective Algorithmic Frameworks
Keywords:
CRISPR-Cas9, guide RNA design, multi-objective optimization, genome editing, off-target effectsAbstract
The precision of CRISPR-Cas9 genome editing is contingent upon the meticulous design of guide RNAs (gRNAs), which is crucial for minimizing off-target mutations. This study introduces a novel multi-objective optimization algorithm to enhance gRNA design, integrating sequence specificity and thermodynamic properties. Through computational simulations and experimental validations, the proposed framework demonstrates superior targeting accuracy and efficiency compared to existing methodologies. These findings suggest a significant advancement in the tailoring of CRISPR-Cas9 tools for precise genome editing applications.
References
Шаповалова, В. В., Шармазанова, Е. П., Бортный, Н. А., & Скорик, А. Р. (2018). Комплексная лучевая диагностика некротического энтероколита у новорожденных. Здоровье ребенка, 13(Приложение 1), 100-106.
Бортный Н.А., Сиротников Е.Л., Бортная Т.Н. Нарушения гемодинамики у пациентов с инфарктом миокарда левого желудочка в разные стадии его ремоделирования по данным лучевых методов исследования // Russian Electronic Journal of Radiology. — 2012. — Том 2. — № 2 (Матер. VI Всерос. Нац. Конгресса лучевых диагностов и терапевтов «Радиология — 2012», 30 мая — 1 июня 2012, г. Москва). — С. 93-94
